Os colegiados do Campus Campos Guarus têm representações diversas que apoiam as tomadas de decisão com o aproveitamento de experiências diferenciadas. Atualmente os seguintes colegiados estão em funcionamento:

• Conselho de Campus;
• Núcleo Docente Estruturante (NDE) do Curso Técnico em Eletrônica Regular:
  Portaria nº 33/2021 - DGCCGUAR/REIT/IFFLU, de 22 de setembro de 2021;
• Núcleo Docente Estruturante (NDE) do Curso Técnico em Eletrônica PROEJA:
  Portaria nº 22/2021 - DGCCGUAR/REIT/IFFLU, de 17 de julho de 2021; 
• Núcleo Docente Estruturante (NDE) do Curso Técnico em Meio Ambiente Integrado ao Ensino Médio Regular:
  Portaria nº 42/2021 - DGCCGUAR/REIT/IFFLU, de 18 de novembro de 2021; 
• Núcleo Docente Estruturante (NDE) do Curso Técnico em Meio Ambiente Integrado ao Ensino Médio PROEJA:
  PORTARIA DGCCGUAR/REIT/IFFLU N° 44, de 12 de dezembro de 2022; 
• Núcleo Docente Estruturante (NDE) do Curso Técnico Subsequente em Eletromecânica: 
  Portaria nº 35/2021 - DGCCGUAR/REIT/IFFLU, de 4 de outubro de 2021; 
• Núcleo Docente Estruturante (NDE) do Curso Técnico Subsequente em Farmácia:
  Portaria nº 28/2021 - DGCCGUAR/REIT/IFFLU, de 3 de setembro de 2021; 
• Núcleo Docente Estruturante (NDE) do Curso Técnico Subsequente em Enfermagem:
  Portaria nº 20/2021 - DGCCGUAR/REIT/IFFLU, de 29 de junho de 2021;
• Núcleo Docente Estruturante (NDE) do Curso Superior de Bacharelado em Enfermagem:
  Portaria nº 45/2021 - DGCCGUAR/REIT/IFFLU, de 29 de novembro de 2021; 
• Núcleo Docente Estruturante (NDE) do Curso Superior de Bacharelado em Engenharia Ambiental:
  Portaria nº 10/2022 - DGCCGUAR/REIT/IFFLU, de 29 de abril de 2022;
• Núcleo Docente Estruturante (NDE) do Curso Superior de Licenciatura em Música:
  Portaria nº 36/2021 - DGCCGUAR/REIT/IFFLU, de 4 de outubro de 2021;
• Colegiados dos Cursos.